掃碼聯(lián)系客服
僅用3組生存曲線圖就搞定的IF13+生信文章是什么水平？
哈嘍，大家好，好久不見~你敢相信嗎？影響因子13+的文章，正文主圖也僅有3組生存曲線圖，1組森林圖，1個表格就搞定了,這種3+1+1的模式，你想不想來復(fù)現(xiàn)一篇？小編帶你看圖說話！
言歸正傳，簡單介紹一下這篇文章：題目為“Prognostic impact of unsupervised early assessment of bulk and leukemic stem cell measurable residual disease in acute myeloid leukemia ”，發(fā)表在《Clinical Cancer Research》雜志上，2021年影響因子13.8，2022年預(yù)測影響因子12.03，可見是一本穩(wěn)妥保持在10+水平的雜志，非常值得嘗試哦~
進入正文之前，先來了解文中涉及到的幾個概念：
1）MRD：即微小殘留病灶（minimal residual disease，MRD）或可測量殘留病灶（molecular residual disease，MRD）。這是一個源自于血液腫瘤的概念，諸如多發(fā)性骨髓瘤、急性淋巴細胞白血病等血液腫瘤患者在治療后可通過流式細胞術(shù)、定量PCR、二代測序（NGS）等高靈敏度的檢測手段對骨髓或外周血樣本中可能存在的微量克隆腫瘤細胞進行檢測，以評估患者治療后體內(nèi)的腫瘤殘留狀態(tài)。化療后不同時間點的MRD檢測對于預(yù)后的指導(dǎo)意義不同，對于AML而言，在誘導(dǎo)治療后、鞏固治療后、移植前以及移植后的任何時間點的MRD陽性都有不同程度的預(yù)后價值，一旦出現(xiàn)陽性即意味著治療不是完全有效并且預(yù)示復(fù)發(fā)的風(fēng)險增大。
2）MFC：即多參數(shù)流式細胞分析技術(shù)（Multiparameterflowcytometry）是白血病診斷和治療監(jiān)測中使用最廣泛的工具。該技術(shù)是運用不同熒光標記的多種抗體組合對造血細胞表面或胞內(nèi)抗原的表達狀況進行檢測，進而對細胞的系列來源、分化程度、表型異常與否進行分析判斷的高通量、高敏感性檢測技術(shù)，其在白血病的診斷分型、治療監(jiān)測、預(yù)后評估及治療靶點篩查中已成為必不可少的工具。
3）FlowSOM：是一種可用于分析流式細胞術(shù)和高維數(shù)據(jù)的算法。流式細胞儀是一種能每秒檢測和測量數(shù)千個細胞或顆粒的特征的技術(shù)。高維的流式細胞數(shù)據(jù)能夠用于檢測蛋白質(zhì)標記物的表達，從而得以前所未有地詳細表征細胞群體。
數(shù)據(jù)來源
圖盧茲大學(xué)醫(yī)院（TUH）的701例患者（中位年齡62歲）在診斷時進行免疫表型，其中336例接受了標準強化化療方案，包括3天柔紅霉素或5天去甲柔比星和7天阿糖胞苷，在某些情況下，可以添加第三種藥物，如米多司妥林、洛莫司汀等。最后，155例患者在誘導(dǎo)化療后的血液學(xué)恢復(fù)后，在第35天至第42天之間通過MFC進行骨髓細胞的MRD評估（補充表1和補充圖1）。
對155名患者的骨髓細胞進行MFC分析，采用了兩種抗體組合：
結(jié)果解析
1.誘導(dǎo)后MRD的預(yù)后影響
患者的隨訪時間中位數(shù)為26.2個月。
Bulk組MRD陽性患者的中位OS為15.2個月，低于MRD陰性患者的中位OS（風(fēng)險比，HR：3.61，p<0.0001，圖1A）。Bulk組MRD陽性患者1年和3年OS分別為57%和38%，陰性患者1年和3年OS分別為92%和74%。
LSC組MRD陽性患者的中位OS為25.0個月，低于MRD陰性患者的中位OS（HR：3.05，p=0.0001，圖1B）。LSC組MRD陽性患者的1年和3年OS分別為73%和46%，陰性患者1年和3年OS分別為85%和77%。
此外，在多變量分析中，Bulk組患者MRD陽性與較差的OS相關(guān)，(HR：2.64；95%CI：1.44-4.84，p=0.002）（補充表3）。
接下來，作者利用相同的方法，分析了患者的無白血病生存期（LFS），簡單敘述如下：
Bulk組MRD陽性患者的中位LFS為7.2個月，低于MRD陰性患者的中位LFS（HR：2.80，p<0.0001，圖1C）。Bulk組MRD陽性患者的1年和3年LFS分別為42%和16%，陰性患者的1年和3年LFS中分別為71%和50%。
LSC組MRD陽性患者的中位LFS為12個月，低于MRD陰性患者的中位LFSHR：2.49，p=0.0002，圖1D）。LSC組MRD陽性患者的1年和3年LFS分別為51%和24%，陰性患者的1年和3年LFS中分別為74%和55%。
此外，在多變量分析中，Bulk組患者MRD陽性（HR：2.91；95%CI：1.66-5.10，p<0.001）和LSC組患者MRD陽性（HR：1.9；95%CI：1.09-3.30，p=0.023）均與較短的LFS獨立相關(guān)（補充表4）。
2.Bulk MRD和LSC MRD聯(lián)合分析
為了更好地描述白血病患者MRD對預(yù)后的影響，基于患者對化療的早期反應(yīng)，根據(jù)Bulk MRD和LSC MRD數(shù)據(jù)定義了3組患者：
1）Bulk MRD和LSC MRD均為陰性的化療敏感患者（Bulk-LSC-；n=57,37%）
2）Bulk MRD為陰性，但LSC MRD為陽性的白血病患者（Bulk-LSC+；n=40,26%）
3）Bulk MRD為陽性的化療耐藥患者（Bulk+；n=58,37%)
然后對這3組患者進行生存預(yù)后分析：
Bulk+組患者的中位OS為15.2個月，Bulk-LSC+組患者的中位OS為38.4個月，均低于Bulk-LSC-組患者的中位OS（圖2A）。
Bulk+組患者的1年和3年OS分別為57% and 38%，Bulk-LSC+組患者的1年和3年OS分別為90% and 57%， Bulk-LSC-組患者的1年和3年OS分別為95% and 86%。
在多變量分析中，Bulk+組患者與更差的OS相關(guān)（HR：6.09；95%CI： 2.45-15.1，p<0.001）（補充表5）。
Bulk+組患者的中位LFS為7.1個月，Bulk-LSC+組患者的中位LFS為13.2個月，均低于Bulk-LSC-組患者的中位LFS（圖2B）。
在多變量分析中，Bulk+組患者（HR： 5.73；95%CI： 2.84-11.5，p<0.001）和Bulk-LSC+組患者（HR： 2.78；95%CI： 1.37-5.65，p=0.005）均與較短的LFS相關(guān)（補充表6）。
3.化療耐藥性和化療敏感性AML患者的特點
為了探索化療耐藥（Bulk+）和化療敏感（Bulk-LSC-）患者之間的細胞遺傳學(xué)和分子差異，作者關(guān)注了隊列中的72例患者（47%），他們有46個基因的遺傳和NGS突變數(shù)據(jù)。該隊列中72例患者復(fù)發(fā)性遺傳異常分布與MRD的相關(guān)性（圖3A）。這些異常根據(jù)癌癥基因組圖譜（TCGA）被定義為7個功能類別，結(jié)合MRD狀態(tài)繪制森林圖，分析功能與MRD狀態(tài)的相關(guān)性。與預(yù)期的一樣，NPM1突變與化學(xué)敏感的Bulk-LSC-組呈正相關(guān)（比值比，OR：3.3；95%CI 1.2-9.5，圖3B）
4.特定AML亞組中的MRD狀態(tài)
作者認為他們的隊列規(guī)模相對較小，但仍然想研究Bulk和LSC MRD在白血病患者特定亞組中的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，在38例患者中檢測到FLT3-ITD突變，在40例患者中檢測到IDH1/2突變，在28例患者中檢測到與野生型FLT3相關(guān)的NPM1突變，在36例患者中檢測到不良細胞遺傳學(xué)突變。
在這些不同亞組中，Bulk+患者的3年OS在21-57%之間變動，3年LFS在0-11%之間變動；Bulk-LSC-患者的3年OS在75-91%之間變動，3年LFS在56-75%之間變動（圖4和表1）。
作者提到，因為病人的數(shù)量較少，導(dǎo)致他們沒有辦法進一步評估Bulk-LSC+患者MRD對預(yù)后的影響。
結(jié)語
雖然，文章主圖只有簡單的4組圖和1個表格，但是通讀原文，我們不難發(fā)現(xiàn)該文章還有很多附錄補充圖，內(nèi)容可以說相當豐富！那從這篇文章中，我們能得到哪些啟發(fā)呢？MRD檢測已成為血液腫瘤療效評價的標準之一, 經(jīng)過科學(xué)家們的嘗試，MRD的概念已經(jīng)開始從血液腫瘤中推廣到實體瘤當中，如肺癌等。對于做實體瘤的小伙伴，如果對這種研究模式感興趣，何不來復(fù)現(xiàn)一篇呢？即使發(fā)不到10+的高分雜志，發(fā)個5+文章，應(yīng)該不難吧？歡迎感興趣的童鞋深入研究哦~
參考文獻：
Canali A, Vergnolle I, Bertoli S,et al.Prognostic impact of unsupervised early assessment of bulk and leukemic stem cell measurable residual disease in acute myeloid leukemia. Clin Cancer Res. 2022 Nov 1:CCR-22-2237. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-22-2237. Epub ahead of print. PMID: 36318706.
