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小編昨天剛預測接下來會有失巢凋亡的生信文章出來，本來計劃過幾天再去搜索一下相關文章，但是直覺告訴我“你現在找找吧，你調研一下說不定就有新文章出現”。結果，不找不知道，一找嚇一跳（還是小編直覺準啊，希望下次買彩票的時候能靈光乍現）
有篇預后模型的生信文章已被Frontiers in Genetics（IF:4.772）接受，（小編上次說了預后模型是比較快且好發的文章）激動的心，顫抖的手，小編我站起來跟您講。
雖然還沒有正式發表，但是這東西你能等嗎，這可是“一個蘿卜一個坑”，它是有時效性的（啊不然拿什么講“創新點“）小編必須立馬分享給大家，不然就真的晚了。
背景
HNSCC是世界上第六大最常見的癌癥，也是頭頸部最常見的惡性腫瘤。
失巢凋亡是一種程序性細胞死亡的形式，它對腫瘤細胞從細胞外基質中獲得分離后的存活至關重要。在侵襲性腫瘤細胞中產生的失巢凋亡抗性已被確定為腫瘤進展的關鍵因素，但是很少有研究關注在頭頸鱗癌失巢凋亡與轉移之間的關系。
于是作者探討了失巢凋亡相關基因在頭頸鱗癌中的預后價值，并進一步探討失巢凋亡相關風險評分組間患者腫瘤微環境的差異。
結果
與預后相關的失巢凋亡相關基因（ANRG）的識別
ANRG獲取：從GeneCard和Harmonizome共獲得358個失巢凋亡相關基因。（注意是相關基因，不是失巢凋亡“嫡系”基因哦，不要問為什么，小編也不知道）
使用單基因cox獲得33個與預后相關的基因，并對這33個基因進行刻畫（圖1），其中有24個與較差的預后顯著相關。
圖1
利用33個ANRG對HNSCC分子亞群進行一致性聚類
該HNSCC隊列可很好地被分為三個亞型，總體生存分析顯示，3種亞型之間的預后有顯著性差異。ANRGs表達熱圖及三個亞型的臨床病理特征表明LTF基因可能是預后良好的因素，并對三個亞型間不同的功能富集途徑進行探索（圖2）。
圖2
三種亞型中的基因表達和免疫浸潤
用箱線圖顯示了三組亞群中ANRG的表達差異，由于與總生存率相關，這些差異基因可能是影響HNSCC患者預后的關鍵分子以及靶向治療的潛在靶點（圖3A）。此外，免疫細胞浸潤水平也有顯著性差異（圖3B），亞型B中激活的CD4、CD8和B淋巴細胞的比例明顯低于其他兩種亞型的。
圖3
預后signature構建和驗證
失巢凋亡相關預后signature展示出良好的預測效能（圖4）。
圖4
不同風險評分組的GSEA和免疫活性
探索在高、低風險得分組中的腫瘤微環境（TME）景觀（圖5）。
圖5
建立HNSCC患者預后列線圖
圖6
ANRG與TME的相關性分析
使用單細胞數據集分析TME中7個ANRGs的表達情況（圖7）。
圖7
藥物敏感性分析
圖8
總之，基于失巢凋亡相關基因構建了一個預后模型能夠很好地預測HNSCC患者的生存率，對與這一模型相關的分子機制的研究。
當小編看完這篇文章的時候，整體感覺就是，怨種啊/（ㄒoㄒ）/~~，明明比去年同水平的文章卷，分析過程掉的頭發應該也不比同類型8分的文章少，這至少是個5的水平才對！（小編就是這么耿直，不接受爛菜葉子臭雞蛋哈哈）
由于還沒有正式發表，所以對于獲取到的內容中一些細節，小編認為還是值得再完善的。但這并不妨礙我們繼續做失巢凋亡相關的研究，因為一個科學問題可以有多種解讀方式。
已經發表的文章方向，大家是都能看到的，小編把它們總結歸納之后預測失巢凋亡會是下一個熱點或者說已經悄悄變成熱點了，現在看來小編說的沒錯。趁它進入大眾視線之前，已經有人在行動了，不要等太久。
